Szpiegostwo, zbrodnia i polityka ścierają się we współczesnej stolicy Meksyku. Błyskotliwy, ale destrukcyjny oficer CIA, jego młoda i ambitna protegowana, Amerykanka meksykańskiego pochodzenia, i natchniony, ale tajemniczy burmistrz walczą o wpływy, podczas gdy miasto przeżywa atak najbardziej morderczego kartelu narkotykowego świata.

Wayne współpracuje z Połączonym Centrum Meksykańsko-Amerykańskim w celu namierzenia sicarios odpowiedzialnych za niedawny przelew krwi. Isa ignoruje rozkaz pozostania w ambasadzie i obserwuje ewentualny trop wiodący do kartelu Guerrero. Lalo naraża swoją karierę, ścierając się z prezydentem o kontrolę nad śledztwem w sprawie ataku narcos.

Isa rekrutuje pierwszego współpracownika, źródło mające związek z kartelem, ale przekracza przy tym granice etyki zawodowej. Ktoś z przeszłości Wayne’a przywołuje przykre i drastyczne wspomnienia. Lalo naraża na szwank dobre relacje z żoną, decydując się stanąć po stronie ofiary gwałtu i postawić przed sądem synów bogatych, wpływowych ludzi. Natomiast plan Bautisty staje się bardziej czytelny.

Wayne, Isa i Pamela realizują niebezpieczną misję infiltrowania skorumpowanej bankier, która mogłaby ich doprowadzić do kartelu Guerrero. Lalo i Isa zacieśniają więzy podczas pracy nad wystawą malarstwa, ale dawne konflikty znów rzucają cień na ich przyjaźń. Sicarios Bautisty przeprowadzają tajną operację, która ma przerażające konsekwencje dla miasta.

Wayne, Isa I Romero pracują gorączkowo, żeby uratować zakładników. Lalo i siły miejskiej policji robią to samo, ale Lalo ma własne cele. Bautista przeprowadza tajemniczy plan z udziałem swoich sicarios. A Wayne i Isa stopniowo odkrywają straszną prawdę o powodzie ataku Bautisty na miasto.

Lalo jest wstrząśnięty niedawnymi wydarzeniami. Zabiera Isę na wycieczkę do rodzinnej posiadłości za miastem, dzięki czemu Isa poznaje jeden z jego największych sekretów. Natomiast Wayne odkrywa słabość Bautisty i wykorzystuje ją do zastawienia na niego pułapki. Ale Bautista też zastawia pułapkę.

Isa przerywa współpracę z Wayne’em z powodu ostatniego rozlewu krwi i angażuje się w zachowania ryzykowne tak zawodowo, jak i prywatnie. Wayne odwiedza kogoś ze swojej przeszłości, a retrospekcja uświadamia nam tragiczne powody jego nienawiści do Bautisty. Fizyczna i duchowa podróż Bautisty w góry Guerrero owocuje decyzją, która będzie miała straszne konsekwencje dla Lalo i całego Meksyku.

Nieautoryzowane działania Wayne’a wychodzą na jaw, gdy narzeczony Isy podąża tropem, który ma szansę wpakować do więzienia Wayne’a i Isę. Aby go oczyścić, Isa musi sprowadzić rzekomego informatora. Tymczasem Bautista grozi Wayne’owi, ale nieoczekiwanie daje mu ujść z życiem. Veronica zaczyna zdawać sobie sprawę z prawdy o swoim małżeństwie. A Lalo brudzi sobie ręce bardziej niż kiedykolwiek.

Dochodzi do bezpośredniej konfrontacji z fatalnym skutkiem między Lalo a kartelem Guerrero. Ryzykowna akcja Wayne’a wikła jego i Isę w konflikt z Północną Federacją. A Isa i Lalo odkrywają prawdę o swoim związku.

W następstwie wydarzeń z poprzedniego odcinka Wayne, Isa, Veronica i Lalo muszą zmierzyć się z prawdą o sobie i swoich związkach. Wraz z końcem sezonu dawne sojusze zostają zerwane, a nowe zaczynają się tworzyć. Główni bohaterowie muszą się przygotować do wojny na nowym polu bitwy.